操作步骤
1. 称0.3-0.5g粪便置于2ml离心管中,加入0.4g Glass Beads,再加入500μl Buffer RC1(注意加入5μl巯基乙 醇) ,100μl Buffer RC2以及500μl水饱和酚(需自备)。涡旋器高速震荡3-5min。
【注意:对含水量丰富的样品,可以预先离心除去部分水分后再称去样品。Buffer RC2是我司独特的腐殖酸除去剂,100μl对大部分样品来说足以有效除去腐殖酸等抑制因子。对一些腐殖酸含量特别丰富的土壤, Buffer RC2的量可以适当增加,但不能超过250μl,否则会严重影响RNA的得率。】
2. 加入200μl Buffer RC3(RC3如有沉淀37℃水浴完全溶解后再用),涡旋5-10分钟。
3. 加入200μl氯仿涡旋。12000 rpm(~13000×g)离心5钟,转600μl上清到1.5ml离心管中,加入180μl Buffe r RC4混匀。
【注意:转移上清时确保不要吸取到沉淀,转移的上清量最好不超过80%。】
4. 冰上放置5min。12000 rpm(~13000×g)离心5钟。 转移上清到新的1.5ml离心管中。
5. 加入二分之一上清体积的 Buffer RC5与与等体积的无水乙醇,充分混匀。如:向500μl 上清中加入250μl Buf fer C3与500μl无水乙醇。
6. 把上述混匀的液体转移到GBS分离柱上。10,000×g离心30秒以结合RNA,弃去滤出液体。
【注意:纯化柱最大容量为750μl,如果混合液大于750μl,请分两次过柱。】
7. 向GBS吸附柱中加入500μl Wash Buffer I 离心30秒,弃废液。
8. 向GBS吸附柱 中加入600μl Wash Buffer II,12,000 rpm (~13,400×g ) 离心30 秒,倒掉废液,GBS吸附 柱放入收集管中。
【注意:Wash Buffer II使用前请先检查是否已加入无水乙醇】
9. 向GBC吸附柱 中加入600μl Wash Buffer II,12,000 rpm (~13,400×g ) 离心30秒,倒掉废液,将GBS吸 附柱放入收集管中。
10. 12,000 rpm(~13,400×g)离心1分钟,倒掉废液,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
【注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,漂洗液中乙醇的残留会影响后续的实验】
11. 将GBS吸附柱转入一新的离心管中,加30-100μl RNase-free Water,室温放置2 分钟,4℃ 12,000 rp m (~13,400×g)离心1分钟。
【注意:洗脱缓冲液体积不应少于30μl,体积过小影响回收效率。且RNA 应保存在-70℃,以防降解。如果想提高 RNA 得率,可重复上步操作一次,合并两次得到的溶液。】